การจำแนกประเภทของกล้วยไม้ตามความแตกต่างของระบบราก เป็นเกณฑ์นี้ นับว่าเป็นประโยชน์ต่อการปลูกเลี้ยงกล้วยไม้อีกทาง เพราะผู้ปลูกเลี้ยงจะได้ใช้หลักเกณฑ์เหล่านี้มาพิจารณาตัดสินใจเลือกใช้เครื่องปลูกและภาชนะที่มีลักษณะและคุณสมบัติให้เหมาะสมกับประเภทของระบบรากกล้วยไม้ นอกจากนี้ยังได้พิจารณาถึงการจัดสภาพของเครื่องปลูกและวิธีการปลูกให้เหมาะสมกับการที่จะอำนวยให้รากกล้วยไม้เจริญแข็งแรงอีกด้วยเนื่องจากกล้วยไม้เป็นพันธุ์ไม้วงศ์ใหญ่และมีลักษณะตลอดจนนิสัยที่แตกต่างกันอย่างแพร่หลาย ทำให้สามารถจำแนกประเภทของกล้วยไม้ตามความแตกต่างของระบบรากได้ 4 ประเภท
1. กล้วยไม้ที่มีระบบรากแบบรากดิน เป็นกล้วยไม้ที่มีระบบรากเกิดจากหัวที่อวบน้ำซึ่งอยู่ใต้ดิน ตัวรากจะมีน้ำมาก ที่พบอยู่ในประเทศไทยมีหลายสกุล เช่น สกุลฮาเบนาเรีย (Habenaria) เพคไทลิส (Pecteilis) เป็นต้น
2. กล้วยไม้ที่มีระบบรากแบบรากกึ่งดิน กล้วยไม้ประเภทนี้ไม่มีหัวอวบน้ำเหมือนประเภทที่มีระบบรากแบบรากดิน เช่น กล้วยไม้สกุลรองเท้านารี (Paphiopedilum) สกุลเอื้องพร้าว (Phaius) เป็นต้น
3. กล้วยไม้ที่มีระบบรากแบบรากกึ่งอากาศ หมายถึงกล้วยไม้ซึ่งโดยธรรมชาติจะขึ้นอยู่บนพื้นดิน บนหิน บนไม้ หากพบขึ้นอยู่บนพื้นดินก็จะอยู่บนพื้นซึ่งมีใบไม้ผุตกทับถมกันค่อนข้างหนา เนื่องจากสภาพที่โปร่งช่วยให้อากาศถ่ายเทได้สะดวก เช่น กล้วยไม้สกุลแคทลียา (Cattleya) สกุลหวาย (Dendrobium) เป็นต้น
4. กล้วยไม้ที่มีระบบรากอากาศ กล้วยไม้ที่มีระบบรากเป็นรากอากาศอย่างแท้จริงนั้น มักพบขึ้นอยู่ตามต้นไม้ รากจะมีขนาดใหญ่และหยาบ เช่น สกุลแวนด้า (Vanda) สกุลช้าง (Rhynchostylis) เป็นต้น
